对于串联重复蛋白特异序列的探究

作者: JackLiew

简介: 由于串联重复蛋白(TRP)结合特定序列的能力及其高变异性,TRP被广泛应用于基因编辑。通过数据库分析,我们发现了TRP蛋白家族pTERF,其重复的特异性结合片段可以自由组合,使其成为潜在的基因编辑工具

最后修改: 2025-06-18 21:29:28.380483

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Struct ural  Insights into t he Spe cific  Bi ndi ng  Mot if  of  T an de Re pe at  Protei ns Au t ho r : Z hi xin Z ha ng Xi ao yu  W an g,  Z i j i L i u Me tho dolo gy R e su lt  An aly sis D isc u ss io n   Fu tu r e   Pl an T and e R e p e a Pr ot e in (TR P s) Fu r t he r   v erif i catio n:  E M S A   E x pe r i m en t Sys te m a ti c   Evo l u ti o n   o L i g a n d s   b y  E x p o n e n ti a l   En ri c h m e n t SEL EX Pro te i n   Pro d u c ti o n   & Pu ri fi c a ti o n Se q u e n c i n g   An a l y s i s Pro te i n W h e n   inc u b a t e d   w it h   it s   t a r g e t   D N A ,   t h e   p r o t e in  f o r m s   a   c o m p lex   t h a t   m igr a t e s   s low e r   in  g e e lec t r o p h o r e s is ,   ind ic a t ing   s p e c if ic   b ind ing . T a n d e m   Rep e a P r o te i n   ( T RP )   i a  g r o u p   o p r o te i n co n ta i n i n g   r e p e ti ti ve   se g m e n ts  w i th   th e   p o te n ti a l   to  sp e ci fi ca l l b i n d   to  t a r g e DN A   se q u e n ce s. Ow i n g  t o   th e i r   a b i l i ty  to   b i n d   sp e ci fi se q u e n ce a n d  t h e i r   h i g h  va r i a b i l i ty,   T RP s a r e   w i d e l u se d  i n   g e n e  e d i ti n g   T h e   T R a b o v e   i s   T AL p ro t e i n .   T h e   N I   a n d   H D   s t ru ct u re s   s p e ci f i ca l l b i n d   t o   a n d   C   b a s e   p a i rs ,   re s p e ct i v e l y. T h e   re p e t i t i v e   s p e ci f i b i n d i n g   s e g m e n t s   ca n   f re e l co m b i n e ,   m a ki n g   i t   a   p o t e n t i a l   g e n e   e d i t i n g   t o o l . T h ro u g h   d a t a b a s e   a n a l ys i s ,   w e   i d e n t i f i e d   a   p o t e n t i a l   T R p ro t e i n   f a m i l f ro C l o s t ri d i a   b a ct e ri u m ,   p T ER F .   P r o t o c o im p r o v e m e n t I d e n t if ic a t ion   o f   s o u r c e   o f   e r r o r e .g . A p p r o p r i a te   i p tg co n ce n tr a ti o n A p p r o p r i a te   n u m b e r   o P CR  cycl e s R e t r o s p e c t iv e   &   c o m p a r a t iv e   a n a ly s is e .g . Hi g h /l o w   i p tg co n ce n tr a ti o n E x ce ssi ve  P CR  cycl e s E x p e r im e n t a e r r o r s e .g . P o o r  p r o te i n   p r o d u cti o n A b n o r m a l  e l e ctr o p h o r e sis  r e su l t How   w e  s o l v e   th e   p ro b l e m s
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